科學施用肥料首先要以上述4個施肥理論為基礎，以高產(chǎn)、優(yōu)質(zhì)、高效、無污染、改良培肥土壤為目標，不僅要根據(jù)肥料的性質(zhì)、作物營養(yǎng)的特點，而且要考慮土壤肥力、栽培制度（地膜覆蓋下的科學施肥、不同輪作制度和間作套種的科學施肥）、灌溉與施肥相結(jié)合等因素。
根據(jù)對作物的有效性可將土壤養(yǎng)分分為速效養(yǎng)分、緩效養(yǎng)分和無效養(yǎng)分；根據(jù)在土壤中的存在形態(tài)可將土壤養(yǎng)分分為水溶態(tài)、交換態(tài)、礦物態(tài)和有機態(tài)。